Return to article

Table 2. Classification of novel alternative splicings according to their splicing types, open reading frame (ORF) changes, and profile in the microarrays^*

Unigene ID   Gene Symbol   Accession No.   Alternative Exon   Alternative Splice Site   Alternative Usage of Promoter*   ORF Change   Highly Expressed in Adult Testis   Hs.113319   KIF2   AY317140     •   •d   •   •s   Hs.118281   ZNF266   AY376240   •       •     Hs.444982   ALS2CR8   AY032876   •   •     •   •   Hs.15250   PECI   AY297537   •     •d   •     Hs.436133   USP32   AF350251   •     •d   •   •s   Hs.178576   CTNNBL1   AF367471   •     •d   •   •s   Hs.323634   STAG3   AY313779   •     •d   •   •s   Hs.407922   RFX4   AF332192   •     •d   •   •   Hs.350939   p44S10   AF359879     •   •   •     Hs.364615   SLC30A9   AY319413     •     •     Hs.279763   FLJ10504   AY334564     •   •d   •   •s   Hs.372719   PHF7   AY334564   •     •d   •   •s   Hs.413074   NFX1   AF332009   •       •     Hs.411098   NPM1   AY347529     •   •       Hs.159087   RAD23B   AY313777     •   •d   •   •s   Hs.409311   FGD4   AY367054   •   •   •d   •   •s   Hs.50334   C9orf24   AF367474     •   •d   •   •   Hs.59838   FLJ10808   AF359880   •     •d   •   •s   Hs.436921   KIAA0586   AY359881   •       •   •   Hs.221688   SRPK2   AY354201     •   •   •   •s   Hs.22315   CREB1   AY347527   •   •     •   •s   Hs.156232   C6orf204   AY313778   •   •   •   •   •s   Hs.401274   SLC2A14   AY357941   •     •d   •   •s   Hs.441069   PIAS2   AF361054   •     •   •   •s   Hs.231975   CREM   AY292864   •   •   •   •   •s   Hs.371698   RAE1   AY349350   •     •d     •   Hs.22587   SSX2IP   AY367055   •   •   •d     •s   Hs.273104   ANKRD28   AY367056   •   •   •d   •   •s   Hs.284491   PDXK   AY303972     •   •d     •s   Hs.468207   NRD1   AY360265   •     •d   •   •s   Hs.412370   RPL9   AY376242     •         Hs.439202   DPP8   AY354202   •     •   •   •   Hs.443292   CPS1   AY317138     •   •d   •   •   Hs.55481   ZNF165   AY366500     •   •d     •   Hs.370123   AP2B1   AY341427   •   •     •   •s   Hs.386939   USP7   AY376241     •   •d   •   •s   Hs.373980   IQGAP2   AY351902   •   •   •d   •   •s   Hs.446140   SEC8L1   AF380839     •   •       Hs.289097   DDX19   AF353720   •     •   •   •s   Hs136885   RNF6   AY009109   •     •   •   •   Hs.440961   CAST   AF327443     •   •   •   •s   Hs.117920   WDR10   AF302154   •       •   •s   Hs.388392   DNAJA1   AY186741   •     •   •   •s   Hs.247302   TWSG1   AF294628     •   •d     •   Hs.69360   KIF2C   AY026505     •   •d   •   •s   Hs.108646   GPD2   AF311325   •     •d   •   •s   Hs.164267   DYRK3   AF327561   •   •     •   •   Hs.178121   MFAP3L   AF327560     •   •d   •   •s   Hs.337625   FLJ10081   AF311326   •     •d   •   •s   Hs.8109   SMYD3   AY186742   •     •d   •   •s   Hs.125139   FLJ11004   AY313780   •     •d   •   •   Hs.78946   CUL3   AY337761     •   •d   •   •s   Hs.99344   BGR   AY009107   •   •     •   •s   Hs.528525   LOC388974   AY354203   •     •   •   •s   Hs.224355   STK31   AF332194     •     •   •s   Hs.74335   HSPCB   AY359878     •         Hs.436349   RTN4   AF333336     •   •d   •   •s   Hs.381219   RPL15   AY347528     •         Hs.408096   FXR1   AY341428     •   •d   •   •   Hs.99881   LDHC   AY286300     •       •s   Hs.234573   LOC220594   AY363305     •   •d   •   •s   Hs.416032   TSGA10   AY014284     •   •d   •   •s   Hs. 178281   BRDT   AY338951   •     •   •   •   Hs.368605   RAI14   AY317139   •   •   •d   •   •s       AY354204             Hs. 129055   ODF2   AY366499   •   •   •   •   •s       AY319414           •s   Hs.2042   CRISP2   AY289796   •   •     •   •s       AY292862           •s       AY292863           •s   Hs.351068   NYD-SP20   AF367472   •   •     •   •s       AY035867           •s       AY035868           •s       AY032684           •s   *A "d" indicates that the novel gene used a downstream promoter and 5; proterminal 5'-terminal was shorter than their splicing counterparts.   An "s" indicates the novel gene was highly expressed in both the adult testis and spermatozoa.

Return to article